Desktop e WEB (C#/ASp.NET)

Galera, é o seguinte.

Comecei a fazer a um sistema pra uma rede academica so que me deparei com o seguinte problema:
´Preciso monitorar o tempo de permanencia do aluno na ´estação de trabalho´ (PC)´.

O que acontece é que temos um webservice que traz a situação do aluno e se ele fez o login corretamente. Só terá acesso ao PC o aluno que logar corretamente.

Tem como substituir aquela janela padrão de Login do Windows por uma criada em C? se SIM, alguem teria uma dica pra me passar?

Outra maneira q identifiquei foi: Ao fazer o login padrao por exemplo:
Usuario: Aluno
Senha: 123456
antes de iniciar o Windows, minha aplicação mostraria uma janela pra ele fazer outro login. Isso seria mais facil, pois ele estando com sua situação normalizada eu liberava o acesso e contava seu tempo de permanencia, caso nao, eu deixaria a tela de login novamente.

Espero encontrar uma ajuda.
Desde já agradeço.

Obrigado!