Como configurar o comando Button no datatable?

Tenho um Datatable e estou usando com PHP que possui apenas 1.000 registros que foi limitado no sql (total é mais de 50.000 registros). Minha dúvida: o botão para criar arquivo do CSV obedece apenas o que está no DataTable? Para trazer os 50.000 registros preciso criar outro select e usar o DataTable sem que o usuário saiba para depois gerar o arquivo CSV? Tem como criar o CSV apenas com o camando sql e gerar o arquivo apenas clicando no botão do CSV? Tem alguma dica? ou Devo usar o trio HTML, CSS, JAVASCRIPT?