Mudando de Windows para Linux

Mudando de Windows para Linux

Estamos mudando nosso servidor Oracle de Windows para Linux, durante os testes um dos problemas que vimos e que na geração de arquivos texto , na leitura via Windows/Dos este não reconhece o fim de linha como no Linux , alguém já passou por isto , pode dar alguma pista ?

Vi uns programas que convertem , mas existe algo mais automático ?