Transferir dados de um banco para outro

Bem, não sei como você pretende fazer isso, mas se for via aplicação, você pode ter dois objetos de conexão ao banco, uma para o FB e outro para Sql Server. Conectado, você então faz suas regras de transferências de dados. Isso eu faço aqui na empresa, onde tenho uma aplicação que roda em dois bancos e dá certo. Agora, se for externo à sua aplicação, você pode exportar em formato xls(excel), xml ou na pior das hipóteses em txt e importar pelo outro banco. Excel e Sql Server trabalham muito bem, ambos.