Boa pratica

Criei uma maquina virtual(CENTOS) e estou fazendo meu site nela para depois jogar tudo para uma VPN, e gostaria de saber se o que estou fazendo é uma boa pratica: PHP: Tenho as classes com as repectivas funcoes e no mesmo arquivo em baixo:


E um arquivo com uma classe com um ajax "customizado" para que nao se repira muito no codigo e deixe-o grande, dai ele chama o arquivo php setando a classe, funcoes e variaveis e retorna um json;