Minha aplicação dá pau no IE

Fiz uma aplicação e no VS2010, funciona em ambos os Browsers: IE e CHROME. Porem, quando eu publiquei ela no IIS, as telas perderam totalmente a formatação. Inclusive, tenho uma tela que ao clicar em dois de três radiobutton de um RadioButtonList, deveria aparecer um TextBox e não aparece. No chrome vai bem. Como eu resolvo isso?