Ajuda MySQL

Boa tarde,

Temos um servidor amazon AWS rodando Centos 7.2 x64, 32GB Memoria Ram, 16 Core processador.
O servidor possui cPanel/WHM, temos aproximadamente 600 projetos rodando em PHP 5.6, MariaDB 10.0.28, Apache 2.4.18.

Ultimamente o número de contas está crescendo absurdamente, e temos notado que o grande gargalo está sendo o MySQL, por não termos um conhecimento tão profundo com MySQL, usamos ferramentas como MySQL Tuner, e Percona para testar quais configurações nos dariam mais desempenho.

Este server tem 1553 databases no momento, aproximadamente 115.000 tabelas.

Se alguém tiver bastante experiência com administração de banco de dados, e nos puder ajudar com qualquer dica útil para melhorar a performance, e diminuição do alto consumo de memória que está acontecendo, salvaria minha vida! :).

Quaisquer informações que precisarem é só pedir.

Obrigado antecipadamente!