Linguagem para automação comercial?!?!

Olá pessoal!
Me chamo Gabriel e acabei de me formar em Sistemas de Informação, e quero começar um projeto para um comércio. Gostaria da opinião de vocês sobre qual linguagem utilizar para um sistema comercial, tendo em vista suas diversas funcionalidades, sendo cadastros, vendas, compras, ECF, PDV, NFE e afins. Pensei em fazer com PHP, pois é a linguagem que mais tenho conhecimento, mas vi comentarem que para automação comercial não é uma linguagem muito apta, visto que seu foco é o backend para sites. Pensei também em Java, mas não sei se utilizar este sistema em um ambiente linux irá interferir de alguma maneira negativa (o sistema rodará em linux). Sei que a melhor linguagem é aquela que o programador possui maior experiência, mas gostaria de um feedback de vocês com relação à isso tudo. Agradeço desde já!